ความร้อนสูง แอร์ไม่เย็น โดยเฉพาะรถที่วางเครื่องเทอร์โบข้ามรุ่นข้ามยี่ห้อ ยิ่งรถยุโรปยิ่งเป็นปัญหามาก เนื่องจากระบบพื้นฐานของเซ็นเซอร์และมาตรวัดต่างๆ จะแตกต่างกันโดยสิ้นเชิง ที่พบเป็นประจำคือเครื่องยนต์ร้อนจัด แต่มาตรวัดความร้อนขึ้นปกติ อย่างกรณีรถ BMW วางเครื่อง 2JZ-GTE แล้วช่างใช้เซ็นเซอร์วัดอุณหภูมิน้ำที่ติดมากับเครื่องต่อเข้าหน้าปัดของรถโดยตรง ค่าที่แสดงจะเป็นค่าที่คลาดเคลื่อนกับความเป็นจริง ช่างที่ดีมีความรู้จะแก้ไขด้วยการนำเซ็นเซอร์ของอุณหภูมิน้ำจากเครื่อง BMW ตัวเดิมมาทำ อะแดพเตอร์เข้ากับเครื่องยนต์ตัวใหม่ เพื่อให้ค่าความร้อนที่แสดงบนหน้าปัดตรงกับความเป็นจริง เรื่องนี้เป็นเรื่องที่เจอบ่อยมากและทำให้อายุการใช้งานของเครื่องสั้นลง หรือเครื่องยนต์วิ่งไม่ออกเพราะความร้อนที่ตัวเครื่องสูงจัด ผลที่ตามมาอีกอย่างคือแอร์จะไม่ค่อยเย็น โดยเฉพาะเวลาที่ความร้อนของเครื่องยนต์ขึ้นสูงหรือตอนกลางวัน
เกียร์เปลี่ยนตำแหน่งไม่ครบ อย่างที่บอกไปว่าพื้นฐานของระบบเซ็นเซอร์ของรถต่างรุ่นหรือต่างยี่ห้อจะใช้พื้นฐานไม่เหมือนกัน อย่างรถบางรุ่นใช้สัญญาณความเร็วจากแผงหน้าปัดมาร่วมในการประมวลผล แต่บางยี่ห้อไม่ได้ใช้จากจุดนี้ ทำให้มีปัญหาว่าเมื่อเปลี่ยนเครื่องแล้วเกียร์เปลี่ยนไม่ครบตำแหน่ง หรือเปลี่ยนแล้วกระตุกเพราะบางระบบไม่ทำงาน เนื่องจากวายริ่งสายไม่ครบ หรือพื้นฐานของระบบไม่เหมือนกัน โดยปกติทั่วไปเวลาเกียร์จะเปลี่ยนตำแหน่ง ระบบจะทำการลดองศาไฟจุดระเบิด เพื่อลดแรงบิดของเครื่องยนต์ ทำให้การเปลี่ยนเกียร์นุ่มนวล เพราะข้ามรุ่นข้ามยี่ห้อก็เลยทำให้เกิดปัญหา เพราะสัญญาณที่นำมาใช้อาจจะส่งออกมาคนละรูปแบบและมีค่าไม่เท่ากันก็ทำให้เกิดปัญหา ซึ่งเรามักจะมองว่าเป็นปัญหามาจากตัวเกียร์
ตัวรถมีการสั่นสะท้าน เวลาเร่งหรือออกตัวอันเป็นผลมาจากการวางเครื่องไม่ได้เซ็นเตอร์ ซึ่งเป็นทั้งรถขับเคลื่อนล้อหน้าและล้อหลัง รวมถึงการตัดต่อเพลากลางและเพลาขับไม่ดีด้วย นอกจากนี้ยังรวมถึงการวางเครื่อง ข้ามรุ่นที่ต้องมีการตัดเฉือนตัวถังมากๆ ทำให้ความแข็งแรงของโครงสร้างลดลง ทำให้เกิดปัญหาเหล่านี้ซึ่งยากมากที่จะแก้ไข บางครั้งก็สามารถแก้ไขได้แต่ต้องเสียค่าใช้จ่ายเหมือนกับวางเครื่องใหม่อีกครั้ง เจ้าของรถส่วนใหญ่ที่เจอปัญหานี้มักจะทนใช้ไปก่อน พอถึงระดับหนึ่งก็ตัดใจขายในที่สุด
เร่งฝืด เบรกตื้อ คลัตช์หนัก เป็นเรื่องที่เจอกันเป็นปกติกับรถที่วางเครื่องข้ามรุ่นข้ามยี่ห้อ และแก้ไม่ค่อยหาย หรือกว่าจะแก้ได้ต้องแปลง ต้องตัดแต่งกันวุ่นวาย
ระบบไฟฟ้าทำงานได้ไม่ครบ เป็นปัญหาที่เจอบ่อยกับรถยุโรปที่วางเครื่องญี่ปุ่น เนื่องจากรถยุโรปโดยส่วนใหญ่นั้นระบบไฟฟ้าจะซับซ้อนมาก ส่วนใหญ่จะแยกกล่องควบคุมต่างหากและระบบอำนวยความสะดวกต่างๆ จะต่อผ่านกล่อง แต่รถญี่ปุ่นมักจะรวมอยู่ในกล่องเดียวกัน และระบบไม่ซับซ้อนเหมือนกับรถยุโรป ปัญหาทั้งหลายเหล่านี้ทำให้เจ้าของรถที่ตัดสินใจเปลี่ยนเครื่องไปแล้วยอมทำใจขาย ซึ่งคนที่จะเดือดร้อนต่อมาก็คือคนซื้อที่ไม่รู้อิโหน่อิเหน่ ต้องมานั่งไล่แก้ปัญหาหรือทนใช้ไปทั้งๆที่มีปัญหาอยู่ ดังนั้นจึงอยากแนะนำว่าถ้าเป็นรถแต่งก็ควรเลือกซื้อเฉพาะรถในกลุ่มแรกที่แนะนำไป แต่ถ้าเป็นที่เปลี่ยนเครื่องมาแล้วไม่ควรซื้อเด็ดขาด เพราะส่วนมากต้องมานั่งตามแก้ปัญหา กว่าจะจบต้องเสียเวลาและเงินทองจำนวนมาก ซึ่งไม่คุ้นกันเลย ถ้าอยากได้รถที่มีเครื่องแรงๆ จริงๆ ให้หารถสภาพเดิมๆ แล้วลงทุนทำเองดีกว่า จะได้ไม่ต้องเข้าข่ายเสียน้อยเสียยากเสียมากเสียง่าย